आयन टोरेंट आयन पीजीएम™ सीक्वेंसर
उपकरण संबंधी विवरण
•निर्माण : लाइफ टेक्नोलॉजी, यूएसए
•मॉडल : आयन टोरेंट आयन पीजीएम ™ अनुक्रमण
विशिष्ट विवरण
• क्षमता: प्रति संचालन 1चिप
• चिप संगतता: आयन 314 टीएम चिप वी2 बीसी, आयन 316 टीएम चिप वी2 बीसी, आयन 318 टीएम चिप वी2बीसी
• टिप्पणियाँ: आयन वन टच™ स्वचालित टेम्पलेट प्रेप प्रणाली के साथ संगत
• डाटा आउटपुट: बीएएम फाइलें, फास्ट्क्यु फाइलें, एसएफएफ फाइलें, वीसीएफ फाइलें
• आकार: 24 इंच (61सेमी) (चौडाई) x 20 इंच (51सेमी) (गहराई) x 21 इंच (53 सेमी (लम्बाई)
• उपकरण के साथ प्रयोग हेतु: आयन पीजीएम™ प्रणाली
• उच्च थ्रूपुट संगतता: उच्च थ्रूपुट-संगत, बहुसंकेतन
• आउटपुट: आयन314 ™ चिप वी2: 100एमबी तक, आयन 316 ™ चिपवी2: 01 जीबी तक, आयन318, ™ चिपवी2: 2 जीबी तक
• उत्पाद लाइन: आयनटोरेंट™, पर्सनल जीनोम मशीन (पीजीएम™)
• उत्पाद का आकार: 1 प्रणाली
• रीडिंगलेंथ : 35-400 आधार (औसत: 200 आधार)
• रीडचिप रन : आयन314 ™ चिपवी2: 400-500 हजार, आयन316 ™ चिपवी2: 2-3 मिलियन, आयन318 ™ चिपवी2: 4-5.5 मिलियन
• संचालन समय: आयन314 ™ चिप वी2: 2.3 से 3.7 घंटा, आयन316 ™ चिपवी2: 3.0 से 4.9 घंटा, आयन 318 ™ चिप वी2: 4.4 से 7.3 घंटा
• तकनीक: पोस्ट-लाइट ™ आयन सेमीकंडक्टर अनुक्रमण
• थ्रूपुट: प्रति संचालन 2 Gb तक
• वजन: 65 पाउंड (30 किग्रा) (फ्री स्टैंडिंग)
कार्य सिद्धांत: जेनेटिक विश्लेषक: केशिका वैद्युतकण संचलन का अवलोकन
आयन पर्सनल जीनोम मशीन (पीजीएम) प्रणाली प्राकृतिक जैव रसायन के साथ अर्धचालक अनुक्रमण तकनीक को जोड़ती है, ताकि रासायनिक डाटा को सीधे डिजिटल डाटा में प्राप्त किया जा सके और अनुक्रमण को सार्वलौकिक कर इसे प्रयोगशाला तक पहुंचाया जा सके।यह स्थापित प्रणाली सेमीकंडक्टर उद्योग (मूर के नियम नाम से जाना जाता है) में हुए सुधार का लाभ उठाते हुए विभिन्न अनुप्रयोगों के लिए मापनीयता और लचीलापन प्रदान करती है। आयन पीजीएम प्रणाली प्राकृतिक रसायन अनुक्रमण का उपयोग करती है, जो महंगी प्रकाशिकी की आवश्यकता को समाप्त करता है और प्राकृतिक डीएनए विस्तार को मापने के लिए प्रयुक्त जटिल प्रक्रिया को आसान बनाता है। यह प्रणाली प्रत्यक्ष, रियल- टाईम अनुक्रमण डिटेक्शन पर कार्य करती है , जिससे अनुक्रमण परिणाम आमतौर पर 3-7 घंटों में मिलते हैं।
आयन टोरेंट™ प्रौद्योगिकी सेमी कंडक्टर चिप पर रासायनिक रूप से एन्कोड की गई सूचनाओं को डिजिटल जानकारी (ए, सी, जी, टी) में तब्दील करती है।सरल प्राकृतिक रसायन विज्ञान के परिणामस्वरूप इससे बेजोड़ एकरूपता प्राप्त होती है। आयनटोरेंट™सरल अनुक्रमण रसायन विज्ञान का उपयोग करता है जिसमें प्राकृतिक न्यूक्लियोटाइड्स, एवं किसी प्रकार के एंजाइमैटिक कैस्केड, प्रतिदीप्ति, प्रकाशिकी, प्रकाश नहीं होता : इसमें चिप ही मशीन है।आयन पीजीएम अनुक्रमण में इष्टतम प्रदर्शन के लिए 3 चिप डेन्सिटी हैं। आयन पीजीएम प्रणाली को जब आयन एमप्लिसेक तकनीक के साथ युग्मित किया जाता है तो वह लघु जीनोम अनुक्रमण, लक्षित डीएनए और आरएनए अनुक्रमण के लिए आदर्श प्रणाली बन जाती है। आयन एम्पलीसेक™ तकनीक विशिष्ट मानव जीन या जीनोमिक क्षेत्रों के सस्ते लक्षित अनुक्रमण के लिए सरल और तीव्र संग्रह में सहायता प्रदान करती है।उच्चतम बहु संकेतक पीसीआर के आधार पर, आयन एम्पलीसेक™ तकनीक को जीन के लक्षित सेट के लिए इनपुट डीएनए के 10 एनजी की आवश्यकता होती है।तीन एम्प्लीसेक पैनल में से किसी का भी चयन किया जा सकता है: रेडी-टू-यूज़, कस्टम पैनल और कम्युनिटीपैनल।
उपकरण की मुख्य विशेषताएं
• शीघ्र और सरल परीक्षण सेटअप
• संवेदनशील एलईडी-आधारित 4 रंग की प्रतिदीप्ति रीडिंग
• कई जीनोमिक विश्लेषण तकनीकों के साथ संगत
• एसएनपी जीनोटाइपिंग
अनुप्रयोग
• माइक्रोबियल रोगजनकों का डीएनए अनुक्रमण |
• पौधों की किस्मों का एपिजेनेटिक अनुक्रमण
• विखंडन विश्लेषण
• जीनोटाइपिंग और मेंटा जीनोमिक प्रोफाइलिंग
• आरएनए अनुक्रमण और पौधे के रोगजनकों की लघु आरएनए प्रोफाइलिंग
संपर्क करें:
• निदेशक, भाकृअनुप-के.आ.अनु.सं, शिमला (हि.प्र) – 171001
फोन: 0177-2625073
मोबाइल: + 91-9418657678
ईमेल आईडी: director.cpri@icar.gov.in