अगली पीढ़ी अनुक्रमण के लिए आयन प्रोटॉन प्रणाली
उपकरण संबंधी विवरण
•निर्माण : लाईफ टेक्नोलॉजी द्वारा निर्मित आयन टॉरेंट
•मॉडल : आयन प्रोटॉन ™ सीक्वेंसर
विशिष्ट विवरण
• क्षमता: प्रति संचालन 1चिप
• चिप संगतता: आयन पीआई™ चिप
• टिप्पणी: आयन वन टच™ स्वचालित टेम्पलेट प्रेप प्रणाली के साथ संगत
• डाटा आउटपुट: बीएएम फाइलें, फास्ट क्यु फाइलें, एसएफएफ फाइलें, वीसीएफ फाइलें
• आकार: गहराई: 30.5 इंच (77.5सेमी), ऊंचाई: 18.7 इंच (47.4सेमी), चौड़ाई: 21.3 इंच (54.2सेमी)
• उपकरण के साथ प्रयोग हेतु: आयनप्रोटॉन™प्रणाली
• उच्च थ्रूपुट संगतता: उच्च थ्रूपुट-संगत, बहुसंकेतन
• मल्टीप्लेक्स क्षमता: डीएनए: 96 ऑफ-द-शेल्फ बारकोड, आरएनए: 16 ऑफ-द-शेल्फ बारकोड, 384 बारकोड तक
• आउटपुट: आयन प्रोटॉनI चिप: प्रति संचालन 2 मानव एक्सोम तक
• उत्पाद लाइन: आयनप्रोटॉन™, आयनटोरेंट™
• उत्पाद का आकार: 1 प्रणाली
रीडलेंथ: 200बीपी तक
• रीड/रन : आयन प्रोटॉनI चिप: 60-80 मिलियन रीड (≥50आधारो पर
पासिंग फ़िल्टर)
• संचालन समय: 2-4 घंटे
• तकनीक: पोस्ट-लाइट ™ आयन अर्धचालक अनुक्रमण
• थ्रूपुट: प्रति संचालन 10जीबी तक (आयनप्रोटॉन चिप)
• वजन: लदान के लिए क्रेटेड : 200 पौंड (90.7 किग्रा), फ्रीस्टैंडिंग: 130 पौंड (59 किग्रा)
विवरण: आयनप्रोटॉन™ प्रणाली प्रथम उपयुक्त अनुक्रमण प्रणाली है जो कुछ ही घंटों में डीएनए-टू-वेरिएंट के साथ एक ही दिन में मानव-स्केल जीनोम, एक्सोम और ट्रांसस्क्रिप्टोम अनुक्रमण प्रदान करने में सक्षम है । यह प्रणाली प्राकृतिक जैव रसायन के साथ अर्धचालक अनुक्रमण तकनीक को जोड़ती है ताकि रासायनिक जानकारी को सीधे डिजिटल डाटा के रूप में प्राप्त किया जा सके।अर्धचालक उद्योग (मूर के नियम के रूप में जाना जाता है) में हुए अत्यधिक सुधार का लाभ उठाकर, आयनप्रोटॉन™ अनुक्रमण प्रणाली उच्च स्तर के थ्रूपुट अनुक्रमण अनुप्रयोगों की एक विस्तृत श्रृंखला जिसमें मानव-स्केल जीनोम से लेकर एक्सोम एवं अनुलेख अनुक्रमण तक शामिल है, का समर्थन करने के लिए मापनीयता और लचीलेपन का एक अभूतपूर्व स्तर प्रदान करती है।सरलतम प्राकृतिक अनुक्रमण रसायन विज्ञान के प्रणालीगत उपयोग से महंगी प्रकाशिकी और जटिल अनुक्रमण रसायन विज्ञान की आवश्यकता समाप्त हो जाती है, जिसके परिणामस्वरूप स्वयं के लिए और संचालन के लिए अत्यधिक सस्ती अनुक्रमण प्रणाली प्राप्त होती है।वास्तविक समय, प्रत्यक्ष अनुक्रमण की विद्युत पहचान, आयनप्रोटॉन™ अनुक्रमक और आयनप्रोटॉन™ टोरेंट सर्वर में अत्यधिक कंप्यूटिंग शक्ति एक ही दिन में डीएनए लाइब्रेरी से वेरिएंट तक उच्च गुणवत्ता वाले अनुक्रमण परिणाम उत्पन्न करने हेतु सक्षम बनाती है।
आयन प्रोटॉन™ प्रणाली की विशेषताएं:
•तीव्रतम उच्च थ्रुपुट आगामी पीढ़ी अनुक्रमण कार्यप्रवाह एवं आयन पीआई ™ चिप पर 2-4 घंटे के संचालन समय सहित तीव्रतम अनुक्रमण ।
• सरल और स्वचालित कार्यप्रवाह (जब आयन वन टच ™ 2 प्रणाली के साथ प्रयोग किया जाता है)सहित प्रति सप्ताह पूर्ण अनुक्रमण संचालन की उच्चतम संख्या।
• मजबूत और सरल हार्डवेयर के साथ सरल अर्धचालक अनुक्रमण कार्यप्रवाह, जो किसी भी कैमरे, प्रकाशिकी और लेजर पर निर्भर नहीं रहता |
•मापनीय, उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण क्षमता जो 200-बेस सिंगल रीड्स और नम्य लाइब्रेरी विकल्प (जैसे फ्रेगमेंट, जीडीएनए, लक्षित / एक्सोम, आरएनए) से सक्षम।
•लघु फुटप्रिंट और बढ़ती क्षमता (वैकल्पिक रैक के साथ) (प्रति रैक में दो आयन प्रोटॉन ™ प्रणाली), एकमात्र सर्वश्रेष्ठ जीनोम केंद्र को आपूर्ति हेतु |
•कम लागत वाले प्लेटफॉर्म और एप्लिकेशन के लिए आकर्षक कीमत वाले सेमीकंडक्टर चिप्स और अभिकर्मक
•सिद्ध आयन सेमीकंडक्टर अनुक्रमण में किसी भी जटिल प्रकाशिकी की आवश्यकता नहीं होती है और सटीक किस्म , कवरेज की एकरूपता, और कम आवृत्ति वाली किस्मों का पता लगाने के लिए संवेदनशीलता हेतु प्राकृतिक न्यूक्लियोटाइड का प्रयोग किया जाता है।
•विभिन्न प्रकार के अनुप्रयोगों, जैसे जीनोमिक अनुक्रमण, एक्सोम अनुक्रमण, जीन समूह अनुक्रमण और आरएनए अनुक्रमण के लिए निम्न इनपुट आवश्यकताओं के साथ तीव्र और सरल लाइब्रेरी समाधान और किट की रेंज।
•प्रोटॉन ™ टोरेंट सर्वर और टोरेंट सूट सॉफ्टवेयर वी 3.0 से बेस कॉल से विभिन्नताओ का पूर्ण समाधान|
•एकल, युग्मित या तीनों नमूनों में डीएनए भिन्नता विश्लेषण के लिए आयन रिपोर्टर ™ सॉफ्टवेयर के साथ तृतीयक डाटा विश्लेषण के लिए सरल और एकीकृत उपकरण।
कार्य सिद्धांत:
•प्रोटॉन ™ प्रणाली: एक्सोम कार्यप्रवाह प्रोटॉन ™ प्रणाली आयन टारगेट सेक ™ एक्सोम किट और आयन रिपोर्टर ™ सॉफ्टवेयर के साथ मिलकर एक सरल और अनुकूलित एक्सोम कार्यप्रवाह और प्रति संचालन दो मानव-स्केल एक्सोम प्रदान करता है।आयन टारगेट सेक ™ एक्सोम किट नवीनतम विषयवस्तु , उच्च कवरेज, एकरूपता और लागत प्रभावी एक्सोम कैप्चर प्रदान करता है। आयन रिपोर्टर ™ सॉफ्टवेयर एक क्लाउड-आधारित उपकरण है, जो अर्धचालक अनुक्रमण डाटा के विश्लेषण, व्याख्या और संग्रह को सुव्यवस्थित और सरल बनाता है, और डीएनए वेरिएंट के तीव्र विवेचन में सहायक है। केवल अनुसंधान उपयोग के लिए। नैदानिक प्रक्रियाओं के लिये इसका प्रयोग नहीं किया जाना चाहिए।
• आयनप्रोटॉन™ प्रणाली पूर्ण अनुलेख कार्यप्रवाह : आयनप्रोटॉन™ प्रणाली, आयन टोटल आरएनए-एसईक्यू किट वी2, रिबोमिनस™ यूकेरियोट किट वी2 और थर्ड पार्टी सॉफ्टवेयर पैकेज जैसे पार्टेक® और एवाडिस® के साथ मिलकर एक सरल और अनुकूलित संपूर्ण अनुलेख कार्यप्रवाह प्रदान करता है।आयन टोटल आरएनए-एसईक्यू किट वी2 स्ट्रैंड ओरिएंटेशन को बनाए रखते और पूर्वाग्रह और त्रुटि को कम करते हुए कुल आरएनए इनपुट के 100एनजी के साथ एक तीव्र, सरल कार्यप्रवाह प्रदान करता है।रिबोमिनस™ यूकेरियोट किट वी 2, 90% से अधिक आरआरएनए का ह्रास कर आयनप्रोटॉन™ प्रणाली की अनुक्रमण शक्ति को बढाता है। थर्ड पार्टी सॉफ्टवेयर पैकेज जैसे पार्टेक® और एवाडिस® आयनप्रोटॉन™ प्रणाली से व्यापक उपकरण और स्व- डाटा विश्लेषण के माध्यम से डाटा विश्लेषण की अवधि को कम करता है । पार्टेक, पार्टेकइंक. का एक पंजीकृत ट्रेडमार्क है। एवाडिस स्ट्रेंड, लाईफ साईंस प्रा.लि. का एक पंजीकृत ट्रेडमार्क है। केवल अनुसंधान उपयोग के लिए। नैदानिक प्रक्रियाओं के लिये इसका प्रयोग नहीं किया जाना चाहिए।
• आयन प्रोटॉन™ प्रणाली लक्षित अनुक्रमण कार्यप्रवाह : आयन प्रोटॉन™ प्रणाली *, आयन एमप्लीसेक™ लक्ष्य चयन तकनीक और आयन रिपोर्टर ™ सॉफ्टवेयर के साथ मिलकर एक सरल और अनुकूलित लक्षित अनुक्रमण कार्यप्रवाह प्रदान करता है। आयन एमप्लीसेक™ तकनीक जीन या जीनोमिक क्षेत्रों के लचीले और सरल लक्षित अनुक्रमण के लिए कस्टम पैनल और रेडी-टू-यूज़ पैनल प्रदान करती है।आयन रिपोर्टर ™ सॉफ्टवेयर एक क्लाउड-आधारित उपकरण है, जो अर्धचालक अनुक्रमण डाटा के विश्लेषण, व्याख्या और संग्रह को सुव्यवस्थित और सरल बनाता है, और डीएनए वेरिएंट के तीव्र विवेचन में सहायक है।
* यहां प्रदत्त विषयवस्तु उन उत्पादों से संबंधित हो सकती है जिन्हें आधिकारिक तौर पर जारी नहीं किया गया है और केवल अनुसंधान उपयोग के लिए बिना नोटिस के इसमें परिवर्तन किया जा सकता है। नैदानिक प्रक्रियाओं के लिए इसका प्रयोग नहीं किया जा सकता है।
अनुप्रयोग
• माइक्रोबियल रोगजनकों का डीएनए अनुक्रमण |
• पौधों की किस्मों का एपिजेनेटिक अनुक्रमण
• विखंडन विश्लेषण
• जीनोटाइपिंग और मेंटा जीनोमिक प्रोफाइलिंग
• आरएनए अनुक्रमण और पौधे के रोगजनकों की लघु आरएनए प्रोफाइलिंग
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