लैबचिप जीएक्स टच 24 (न्यूक्लिक एसिड सेपरेशन प्रणाली)

उपकरण विवरण

• निर्माण : पर्किनएल्मर, यूएसए

•मॉडल:लैबचिप जीएक्स टच 24

विशिष्ट विवरण :

• जीनोमिक आकार और परिमाण के लिए व्यापक समाधान

• डीएनए और आरएनए नमूनों के इंटीग्रिटी हॉर का अगरोस जैल की तुलना में तेजी से मात्रामापन

• यह तरल बायोप्सी / सेल-फ्री डीएनए , पीसीआर-फ्री और चिप-सेक जैसे दुर्लभ या कम-सांद्रता वाले नमूनों की सांद्रता अधिकतम करता है ।

• डीएनए स्मीयरों के लिए 25 पीजी / यूएल और फ्रेगमेंट के लिए .5 पीजी / यूएल का   सटीक मात्रामापन

• पूर्ण एनजीएस लाइब्रेरी प्रेप और क्यूसी

• लचीले थ्रूपुट विकल्प - 96 या 384 वेल प्रारूप - जो इसे लागत-प्रभावी बनाता है

• डाटा विज़ुअलाइज़ेशन विकल्प (वैद्युतकणसंचलन, वर्चुअल जेल, या सारणीबद्ध रिपोर्ट)

कार्य सिद्धांत: आनुवंशिक विश्लेषक: केशिका वैद्युतकण संचलन अवलोकन

लैब चिप जीएक्स एस्से पारंपरिक जेल वैद्युतकण संचलन सिद्धांतों पर आधारित हैं जिसे एक चिप में परिवर्तित किया गया है। इसका चिप फॉर्मेट नाटकीय रूप से पृथक्करण समय को कम करता है और डिजिटल प्रारूप में स्वचालित आकार और मात्रात्मक जानकारी प्रदान करता है।चिप में आपस में जुड़े हुए सूक्ष्म माध्यम के समूह हैं जो पृथक्करण माध्यम एवं बफर वेल को जोड़ते है |सूक्ष्म माध्यम में से एक छोटी केशिका से जुड़ा होता है जो 90 डिग्री के कोण पर चिप से निकलता है।

केशिका परीक्षण के दौरान एक माइक्रोप्लेट के वेल से नमूना लिया जाता है। चिप में कुछ चैनल दूसरों की तुलना में बड़े होते हैं।बड़े चैनलों में बफर होते हैं। चिप तैयार करने के दौरान, छोटे चैनल और कुछ वेल को सीविंग जेल और बफर से भरा जाता है ।चैनल भरे जाने के बाद, चिप एक एकीकृत विद्युत सर्किट के रूप में कार्य करती है।

सर्किट इलेक्ट्रोड कार्ट्रिज के 7 इलेक्ट्रोड द्वारा संचालित होता है जो चिप धारक के बंद होने पर चिप के वेल में उपलब्ध विलयन के संपर्क में आता है।प्रत्येक इलेक्ट्रोड एक स्वतंत्र बिजली आपूर्ति से जुड़ा होता है जो अधिकतम नियंत्रण और लचीलापन प्रदान करता है।चिप में छोटे चैनलों को भरने वाले बहुलक को आकार अनुसार डीएनए / आरएनए के फ्रेगमेंट या प्रोटीन पृथक करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, क्योंकि वे इलेक्ट्रोफोरेसिस के माध्यम से संचालित होते हैं, यह एगगरोस या पॉलीक्रैलेमाइड जैल का उपयोग करने के समान है।नमूने और सिविंग बफ़र में एक फ्लोरोसेंट डाई भी होती है, जो डबल-स्ट्रेंडिड डीएनए, आरएनए, या प्रोटीन / एसडीएस कॉम्प्लेक्स के संपर्क में आने पर प्रज्वलित हो जाती है।

चिप में, प्रत्येक नमूने पर नकारात्मक दबाव तब तक डाला जाता है जब तक कि यह चिप में पर्याप्त मात्रा में लोड न हो जाए।नमूना को फिर केंद्रीय चैनल में इलेक्ट्रोफोरेटिक रूप से ले जाया जाता है।जैसे-जैसे फ्रेगमेंट केंद्रीय चैनल से नीचे जाते हैं, वे आकार अनुसार अलग-अलग हो जाते हैं, अंत में वह लेजर से होकर गुज़रते है जो अणु से सम्बंधित फ्लोरोसेंट डाई को प्रदीप्त करता है। सॉफ्टवेयर समय प्रतिदीप्ति तीव्रता उत्पन्न करता है और प्रत्येक नमूने के लिए वैद्युतकणसंचलन का उत्पादन करता है। सांद्रता का परिमाण एवं प्रत्येक फ्रेगमेंट के सटीक आकार का पता आकार संबंधी सूची से तुलना एवं प्रत्येक नमूने पर आंतरिक मानक अथवा "मार्कर" लागू कर, लगाया जा सकता है| ज्ञात सांद्रता के आंतरिक मानकों को मात्रा मापन में सहायता के लिए नमूने के साथ मिलाया जाता है।

चिप में डाले गए नमूने की पीएच मात्रा, नमक की सांद्रता और बफर एडिटिव पर निर्भर करती है।आंतरिक मानक इन कारकों को सामान्य करते हैं ताकि सॉफ्टवेयर मानक वक्र क्षेत्र के अनुपात का उपयोग कर अज्ञात पीक पर ले जाकर सांद्रता को निर्धारित करते है । आंतरिक मानक परख सीमा से थोड़ा बाहर होते हैं ताकि वे विश्लेषण में हस्तक्षेप न करें।उपकरण की मुख्य विशेषताएं: लगभग 30 सेकंड में जीनोमिक सामग्री के पूर्ण विश्लेषण के साथ, लैबचिप जी एक्स टच प्रणाली से न्यूक्लिक एसिड की मात्रा अब कार्य प्रगति में अड़चन उत्पन्न नहीं करती है।उच्च-रिज़ॉल्यूशन विश्लेषण 2 पीजी / यूएल के रूप में छोटे 5 बीपी तक के नमूने को स्मीयर करता है और डीएनए फ्रेगमेंट को सटीक आकार और मात्रा प्रदान करता है ।जब इसका प्रयोग आरएनए विश्लेषण के लिए किया जाता है, तो यह प्रत्येक नमूने के लिए महत्वपूर्ण आरएनए मैट्रिक्स प्रदान करता है जैसे कि पीक हाइट, पीक क्षेत्र और सांद्रता जिसे आरक्युएस (आरएनए गुणवत्ता स्कोर) निर्धारित करने के लिए उपयोग किया जाता है। आरक्युएस गणना, एजिलेंट के आरआईएन (आरएनए इंटीग्रिटी नंबर) के साथ सहसंबंधित करने के लिए मान्य की गई है और यह उसी 0-10 पैमाने की रेटिंग का अनुसरण करती है।लैबचिप जी एक्स टच प्रणाली एनजीएस 3 के परख सहित डीएनए विश्लेषण विकल्पों की एक विस्तृत विविधता प्रदान करती है, जो न्यूनतम इनपुट आवश्यकताओं के साथ अद्वितीय जीनोमिक डाटा की गुणवत्ता प्रदान करता है।संवेदनशीलता का यह उच्च स्तर इसे वहां,जहां सांद्रता कम है, नमूने कीमती हैं, और उनका संरक्षण आवश्यक है, के लिए जीडीएनए, सीएफडीएनए और पीसीआर-मुक्त मात्रामापन हेतु आदर्श साधन बनाता   है।

अनुप्रयोग:

• एनजीएस संग्रहण की तैयारी (स्मीयर एंड फ्रैगमेंट विश्लेषण ) और गुणवत्ता नियंत्रण

• आरएनए और डीएनए फ्रैगमेंट विश्लेषण (सीएफ-डीएनए, तरल बायोप्सी और पीसीआर मुक्त नमूनों सहित)

• सीआरआईएसपीआर लक्ष्यीकरण के लिए मात्रामापन और योग्यता

• समय लेने वाली अगरोस जेल की कार्य प्रगति में परिवर्तन कर उसे स्वचालित बनाना

• स्वचालित केशिका वैद्युतकण संचलन पृथक्करण का उपयोग कर डीएनए और आरएनए की मात्रा और आकार के बारे में कुछ ही सेकंड में पता लगाया जा सकता है

 

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